| Municipio | Superficie (Ha.) | Superficie zona protección (Ha.) | |
| Parques Nacionales | |||
| Doñana | Huelva: Almonte, Hinojos Sevilla: Aznalcázar, Puebla del Río | 50.720 | - |
| Parques Naturales | |||
| Cabo de Gata - Níjar | Almería: Almería, Carboneras, Níjar | 33.663 | - |
| Sierra María - Los Vélez | Almería: Chirivel, María, Vélez Blanco, Vélez Rubio | 22.500 | - |
| De la Breña y Pinar de Barbate | Cádiz: Barbate, Vejer de la Frontera | 3.797 | - |
| Bahía de Cádiz | Cádiz: Cádiz, Chiclana de la Frontera, El Puerto de Santa María, Puerto Real, San Fernando | 10.000 | - |
| Los Alcornocales | Cádiz: Alcalá de los Gazules, Algar, Algeciras, Arcos de la Frontera, Los Barrios, Benaocaz, El Bosque, Castellar de la Frontera,Jerez de la Frontera, Jimena de la Frontera, Medina Sidonia, Prado del Rey, Tarifa, Ubrique Málaga: Cortes de la Frontera | 170.025 | - |
| Sierra de Grazalema | Cádiz: Benaocaz, El Bosque, El Gastor, Grazalema, Prado de Rey, Ubrique, Villaluenga del Rosario, Zahara de la Sierra Málaga: Benaoján, Cortes de la Frontera, Jimena de Líbar, Montejaque, Ronda | 51.695 | - |
| Sierra de Cardeña y Montoro | Córdoba: Cardeña, Montoro | 41.212 | - |
| Sierra de Hornachuelos | Córdoba: Almodóvar del Río, Córdoba, Hornachuelos, Posadas Villaviciosa de Córdoba | 67.202 | - |
| Sierras Subbéticas | Córdoba: Cabra, Carcabuey, Doña Mencía, Iznájar, Luque, Priego de Córdoba, Rute, Zuheros | 31.568 | - |
| Sierra de Baza | Granada: Baza, Caniles, Dólar, Gor, Valle de Zalabí | 52.337 | - |
| Sierra de Castril | Granada: Castril | 12.265 | - |
| Sierra de Huétor | Granada: Alfacar, Beas de Granada, Cogollos Vega, Diezma, Huétor-Santillán, Nívar, Víznar | 12.428 | - |
| Sierra Nevada | Granada: Aldeire, Alpujarra de la Sierra, Bérchules, Bubión, Busquístar, Cádiar, Cañar, Capileira, Carataunas, Castaras,
Cogollos de Guadix, Dílar, Dólar, Dúrcal, Ferreira, Gójar, Güéjar-Sierra, Huéneja, Jerez del Marquesado, Juviles, La Calahorra, Lanjarón, Lanteira, Lecrín, Lugros, Monachil, Nevada,
Nigüelas, Orgiva, Padul, Pampaneira, Pórtugos, Soportújar, La Tahá, Trévelez, Valor, La Zubia Almería: Abla, Abrucena, Alboloduy, Alcolea, Alhabia, Almócita, Alsodux, Bayárcal, Beires, Bentarique, Canjáyar, Las Tres Villas, Fiñana, Fondón, Illar, Instinción, Láujar de Andarax, Nacimiento, Ohanes, Padules, Paterna del Río, Rágol, Santa Cruz, Terque | 140.200 | - |
| Entorno de Doñana | Cádiz: Sanlúcar de Barrameda Huelva: Almonte, Hinojos, Lucena del Puerto, Moguer, Palos de la Frontera Sevilla: Aznalcázar, La Puebla del Río, Villafranco del Guadalquivir, Villamanrique de la Condesa | 54.250 | - |
| Sierra de Aracena y Picos de Aroche | Huelva: Alájar, Almonaster la Real, Aracena, Aroche, Arroyomo- linos de León, Cala, Cañaveral de León, Castaño del Robledo, Corteconcepción, Cortegana, Cortelazor, Cumbres de San Bartolomé, Cumbres de Enmedio, Cumbres Mayores, Encinasola, Fuenteheridos, Galaroza, Higuera de la Sierra, Hinojales, Jabugo, La Nava, Linares de la Sierra, Los Marines, Puerto-Moral, Santa Olalla de Cala, Santa Ana la Real, Valdelarco, Zufre | 186.308 | - |
| Despeñaperros | Jaén: Santa Elena | 6.000 | - |
| Sierras de Andújar | Jaén: Andújar, Baños de la Encina, Marmolejo, Villanueva de la Reina | 60.800 | - |
| Sierras de Cazorla, Segura y Las Villas | Jaén: Beas de Segura, Benatae, Cazorla, Chillúevar,Génave, Hinojares, Hornos de Segura, Huesa, La Iruela, Iznatoraf, Orcera, Peal de Becerro, Pozo-Alcón, Puerta de Segura, Quesada, Santiago Pontones, Santo Tomé, Segura de la Sierra, Siles, Sorihuela del Guadalimar, Torres de Albánchez, Villacarrillo, Villanueva del Arzobispo | 214.000 | - |
| Sierra Mágina | Jaén: Albánchez de Ubeda, Bedmar y Garcíez, Bélmez de la Moraleda, Cambil, Huelma, Jimena, Jódar, Pegalajar, Torres | 19.900 | - |
| Montes de Málaga | Málaga: Casabermeja, Málaga | 4.762 | - |
| Sierra de las Nieves | Málaga: Istán, Monda, Parauta, Ronda, Tolox, Yunquera | 16.564 | - |
| Sierra Norte | Sevilla: Alanís, Almadén de la Plata, Cazalla de la Sierra, Constantina, Guadalcanal, Las Navas de la Concepción, El Pedroso, La Puebla de los Infantes, El Real de la Jara, San Nicolás del Puerto | 164.840 | - |
| Parajes Naturales | |||
| Desierto de Tabernas | Almería:Alboloduy, Gádor, Gérgal, Santa Cruz, Tabernas | 11.625 | - |
| Karst en Yesos de Sorbas | Almería: Sorbas | 2.375 | - |
| Punta Entinas-Sabinar | Almería: El Ejido, Roquetas de Mar | 1.960 | - |
| Sierra Alhamilla | Almería: Almería, Lucainena de las Torres, Níjar, Pechina, Rioja, Tabernas | 8.500 | - |
| Cola del Embalse de Arcos | Cádiz: Arcos de la Frontera | 120 | - |
| Cola del Embalse de Bornos | Cádiz: Arcos de la Frontera, Bornos, Villamartín | 630 | - |
| Estuario del río Guadiaro | Cádiz: San Roque | 27 | - |
| Isla del Trocadero (3) | Cádiz: Puerto Real | 525 | - |
| Marismas de Sancti Petri (3) | Cádiz: Chiclana de la Frontera | 170 | - |
| Marismas del río Palmones | Cádiz: Algeciras, Los Barrios | 58 | - |
| Playa de los Lances | Cádiz: Tarifa | 226 | - |
| Embalse de Cordobilla | Córdoba: Aguilar de la Frontera, Puente Genil Sevilla: Badolatosa | 1.460 | - |
| Embalse de Malpasillo | Córdoba: Lucena Sevilla: Badolatosa | 512 | - |
| Enebrales de Punta Umbría | Huelva: Punta Umbría | 162 | - |
| Estero de Domingo Rubio | Huelva: Palos de la Frontera | 480 | - |
| Lagunas de Palos y Las Madres | Huelva: Moguer, Palos de la Frontera | 693 | - |
| Marismas de Isla Cristina | Huelva: Ayamonte, Isla Cristina | 2.145 | - |
| Marismas del Odiel | Huelva: Aljaraque, Gibraleón, Huelva, Punta Umbría | 7.185 | - |
| Marismas del río Piedras y Flecha del Rompido | Huelva: Cartaya, Lepe | 2.530 | - |
| Peñas de Aroche | Huelva: Aroche | 718 | - |
| Sierra Pelada y Ribera del Aserrador | Huelva: Aroche, Cortegana, Rosal de la Frontera | 12.980 | - |
| Alto Guadalquivir | Jaén: Cazorla, Jódar, Peal de Becerro, Torreperojil | 663 | - |
| Cascada de Cimbarra | Jaén: Aldeaquemada | 534 | - |
| Laguna Grande | Jaén: Alcaudete | 206 | - |
| Acantilados de Maro-Cerro Gordo | Granada: Almuñécar Málaga: Nerja | 395 | - |
| Desembocadura del Guadalhorce | Málaga: Málaga | 67 | - |
| Desfiladero de los Gaitanes | Málaga: Alora, Ardales, Bobadilla | 2.016 | - |
| Los Reales de Sierra Bermeja | Málaga: Casares, Estepona, Genalguacil | 1.236 | - |
| Sierra Crestellina | Málaga: Casares | 478 | - |
| Torcal de Antequera | Málaga: Antequera | 1.171 | - |
| Brazo del Este | Sevilla: Coria del Río, Dos Hermanas, La Puebla, Utrera | 1.336 | - |
| Reservas Naturales | |||
| Albufera de Adra | Almería: Adra | 65 | 152 |
| Punta Entinas-Sabinar (1) | Almería: El Ejido | 785 | - |
| Complejo Endorreico de Chiclana | Cádiz: Chiclana, Medina Sidonia | 49 | 518 |
| Complejo Endorreico de Espera | Cádiz: Espera | 59 | 379 |
| Complejo Endorreico de Puerto Real | Cádiz: Puerto Real | 104 | 735 |
| Complejo Endorreico del Puerto de Santa María | Cádiz: El Puerto de Santa María | 63 | 228 |
| Lagunas de las Canteras y el Tejón | Cádiz: Jerez de la Frontera | 4 | 200 |
| Laguna de Medina | Cádiz: Jerez de la Frontera | 121 | 254 |
| Peñón de Zaframagón | Cádiz: Olvera Sevilla: Coripe | 135 | 311 |
| Laguna Amarga | Córdoba: Lucena | 13 | 250 |
| Laguna del Conde | Córdoba: Luque | 11 | 78 |
| Laguna de los Jarales | Córdoba: Lucena | 5 | 117 |
| Laguna del Rincón | Córdoba: Aguilar de la Frontera | 7 | 130 |
| Laguna de Tíscar | Córdoba: Puente Genil | 21 | 170 |
| Laguna de Zóñar | Córdoba: Aguilar de la Frontera | 66 | 304 |
| Isla de Enmedio (2) | Huelva: Huelva | 480 | - |
| Laguna de El Portil | Huelva: Punta Umbría | 16 | 1.300 |
| Marisma de El Burro (2) | Huelva: Huelva | 597 | - |
| Laguna Honda | Jaén: Alcaudete | 65 | 220 |
| Laguna del Chinche | Jaén: Alcaudete | 7 | 39 |
| Lagunas de Archidona | Málaga: Archidona | 6 | 187 |
| Lagunas de Campillos | Málaga: Campillos | 80 | 1.046 |
| Laguna de Fuente de Piedra | Málaga: Fuente de Piedra | 1.364 | - |
| Laguna de la Ratosa | Málaga: Alameda, Humilladero | 23 | 145 |
| Complejo Endorreico de La Lantejuela | Sevilla: Osuna | 66 | 701 |
| Complejo Endorreico de Lebrija - Las Cabezas | Sevilla: Las Cabezas de San Juan, Lebrija | 23 | 860 |
| Complejo Endorreico de Utrera | Sevilla: Utrera | 100 | 1.097 |
| Laguna del Gosque | Sevilla: Martín de la Jara | 28 | 428 |
| Parques Periurbanos | |||
| Los Villares | Córdoba: Córdoba | 484 | - |
| Monte la Sierra | Jaén: Jaén | 2.720 | - |
| Dehesa del Generalife | Granada: Granada | 458 | - |
| Reservas Naturales Concertadas | |||
| Cañada de los Pájaros | Sevilla: Puebla del Río | 8 | - |
| Laguna de la Paja | Cádiz: Chiclana de la Frontera | 40 | - |